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学院现有硕士学位研究生专业5个。
（一）控制科学与工程 学科 控制理论与控制工程 专业 （代码：081101）
主要研究方向：
1、鲁棒控制理论及应用
2、智能控制与智能系统
3、信息融合技术
4、生产过程的综合自动化
（二）控制科学与工程学科 检测技术与自动化装置 专业 （代码：081102 ）
主要研究方向：
1、智能检测与传感器技术
2、智能仪表与控制装置
3、虚拟仪器与可视化软件技术
4、嵌入式系统
5、光电技术及系统
（三）控制科学与工程学科 系统工程 专业（代码：081103）
主要研究方向：
1、系统建模与仿真
2、系统优化调度
3、信息集成与信息化
（四）控制科学与工程学科 模式识别与智能系统 专业 （代码：081104）
主要研究方向：
1、人工智能与模式识别
2、智能信息处理
3、图像处理和计算机视觉
4、智能机器人
（五）仪器科学与技术学科 测试计量技术及仪器 专业（代码：080402）
主要研究方向：
1、传感技术与智能仪器
2、检测技术与生物信息处理
3、精密测量及光电检测技术
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