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计算机学院是在1980年设立的计算机专业的基础上发展起来的。1980年9月开始面向全国招收了第一批计算机应用专业本科生，1981年开始招收计算机应用技术硕士研究生。1984年5月设立的电子计算机系。2000年7月，为适应信息学科快速发展的需要，成立计算机学院。2001年7月，经浙江省教育厅批准，以计算机学院为依托，成立浙江省省属高校第一家软件学院。2002年7月软件学院独立建制。2004年10月，计算机学院与软件学院合并，组成新的计算机学院。
1993年获得计算机应用技术专业硕士学位授予权，1998年获得计算机软件与理论专业硕士学位授予权，2003年学院获得计算机技术、软件工程两个领域的工程硕士学位授予权，2005年获得计算机科学与技术一级学科硕士学位授予权和二级学科计算机系统结构硕士学位授予权。2000年计算机应用技术成为省重点学科，计算机软件与理论成为信息产业部重点学科，2004年计算机科学与工程成为浙江省重点学科（A类）。2008年计算机应用技术成为浙江省高校重中之重学科。
目前学院已拥有计算机科学与技术（1980年）、教育技术学（2001年）、软件工程（2003年）、网络工程（2004年）、数字媒体技术（2005年）等五个本科专业，其中“计算机科学与技术”是国家特色建设专业、国家管理专业、浙江省重点专业，“软件工程”为浙江省重点专业。
学院拥有一支结构合理、具有较高学术水平与研究能力的学科梯队，现有教职工150余人，其中博士生导师2人、教授26人、副教授43人、具有博士学位教师67人、硕士学位教师53人。学院拥有共享院士1人（杭州电子科技大学计算机学院名誉院长），浙江省高等学校“钱江高级人才”（特聘教授）1人，教育部“新世纪优秀人才支持计划”2人，教育部“优秀青年教师资助计划”1人，浙江省“151人才工程”一层次3人，浙江省“151人才工程”三层次8人，浙江省中青年学科带头人7人，浙江省教学名师1人、浙江省优秀教育工作者1人。现在读本科生2500余人、研究生360余人。
在长期的办学过程中，学院始终致力于培养德智体美全面发展、具有创新精神和实践能力的高素质人才。学生在“ACM国际大学生程序设计竞赛”、“浙江省大学生程序设计竞赛”、“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛、“数学建模”、“电子设计”、“全国嵌入式系统竞赛”、“浙江省大学生多媒体作品设计竞赛”等国内外学科性竞赛中连创佳绩，展示了很高的基本理论和基本技能水平、良好的创新能力和综合素质。我院学生2001年以来连续七年获得“计算机世界奖学金”，近三年400多位学生获得国家颁发的系统分析师、软件设计师或网络工程师证书。毕业生基础知识扎实，动手能力强，考研录取率高，就业质量好。
学院建有国家级计算机实验教学示范中心，该中心已成为一个具有坚实的学科基础、先进的实验教学体系、一流环境的实验实训教学基地和工程创新能力培育基地。积极开展教育教学改革工作，获得国家教学成果二等奖3项、国家级教学团队1个、国家特色专业建设点1个、国家级精品课程1门、浙江省教学成果一等奖5项、浙江省精品课程2门，浙江省高校人才培养模式创新实验区1个。
学院拥有信息产业部计算机应用技术重点实验室、浙江省嵌入式技术联合重点实验室、财政部专项资助的虚拟现实实验室、网络教育技术实验室和电子政务实验室等等优良的教学、科研与创新平台，参与建设省部共建的检测仪表与自动化系统集成技术教育部工程研究中心，并与美国SavaJe公司合作成立TD-SCDMA研发中心等。
目前学院在机器视觉与认知计算方向、嵌入式系统与智能控制、无线网络与分布式系统、计算智能与网络安全、图形图像与虚拟现实技术等五个主要研究方向上形成自己的特色和优势，近五年来主持和承担了一批国家自然科学基金、国家“863”项目、“973”子课题、军事电子预研基金、电子信息产业发展基金、国防重点实验室基金和浙江省重大科技专项等项目，研究成果获国家技术发明奖二等奖1项，浙江省政府科学技术奖一等奖1项，二等奖3项，三等奖9项，国家发明专利7项，在国内外重要刊物和会议上发表论文700余篇，其中三大收录200余篇，出版专著（译著）9部。这些研究成果为我国信息产业的发展和浙江省经济建设作出了积极贡献。
学院注重学术交流与对外办学，与德国Fraunhofer IMK媒体研究所、德国安哈特应用工程技术大学、爱尔兰都柏林城市大学、香港城市大学、香港科技大学等科研院所、著名高校建立了良好的合作关系，承办多次国际学术会议和国内学术会议，在学生交流、学术交流、联合办学等方面取得良好的成果。
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