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学院现有自动化、电子信息技术及仪器（原测控技术与仪器）、电气工程与自动化、生物医学工程等四个本科专业。一个博士点授予立项建设一级学科（控制科学与工程），一个国防特色主干学科（控制理论与控制工程），一个国防特色重点专业（自动化），一个浙江省重中之重学科（控制科学与工程），一个浙江省重点专业（自动化），一个一级学科硕士点（控制科学与工程），六个二级学科硕士点（控制理论与控制工程、模式识别与智能系统、检测技术与自动化装置、系统工程、导航与制导、测试计量技术及仪器），以及一个教育部工程研究中心、一个国防重点学科实验室，一个国家财政部资助重点实验室、三个浙江省财政厅资助重点实验室。学院实验室总面积达4000余平方米，设备总资产5000余万。
作为浙江省重中之重学科和信息产业部重点学科，学院紧密围绕国家建设需要，以“立足浙江、依托行业、服务地方、支持国防”作为建设方针。通过交流、合作与引进，积极推进学科交叉，发展新兴学科，强化国防特色，实现学院发展的新突破。
自2000年以来，学院已承担国家、省部级等科研项目180余项（含国防项目18项），其中包含了国家杰出青年科学基金，国家自然科学基金重点项目，国家“863”重点项目等国家级高水平项目，总经费达9000余万元，获得包括国家科技进步二等奖在内的各类省部级奖项18项。学院现有教职工126人，其中教授30人（博导8人），副教授39人，具有博士学位教师81人。拥有国家杰出青年基金获得者1人、浙江省有突出贡献中青年专家1人、浙江省特聘教授1人、教育部新世纪优秀人才1人、浙江省151人才工程第一、二层次5人、总装备部科技委专业组专家1人、教育部电子信息与电气学科教学指导委员会委员1人、自动化专业教学指导分委员会副主任1人、中国自动化学会常务理事1人，基本形成一支年龄结构合理、凝聚力强、具有优秀教学科研能力的创新团队。学院还聘请共享院士3人，兼职教授和海外学者讲座教授7人，与美国、加拿大、英国、澳大利亚等国大学和科研机构建立了良好的学术交流和科技合作关系。
学院经过几年的办学实践，积累了丰富的教书育人经验。特别注重学生创新思维、创新能力和实践能力的培养，使之具备很强的社会适应能力。学院的教学质量不断提高，近年来在大学生“国际、国内数学建模”、“电子设计竞赛”、“嵌入式系统设计大赛”、“计算机仿真大赛”、“机器人足球赛”、“挑战杯”、“大学生课外科技作品大赛”、“大学生程序设计竞赛”、飞思卡尔杯全国大学生智能汽车竞赛等国家和省级学生科研竞赛中不断取得优异成绩，毕业生的硕士研究生考取率高。学院还专门开辟150M2房间给本科生做科技创新实验室，自动化学院培养的毕业生对计算机、自动控制、仪器仪表、生物医学工程、信息处理等领域均具有很强的适应性，受到了社会的普遍欢迎。
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