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本学科1979年开始招收硕士研究生；1981年被原国家教委正式确定为国内首批“植物生理生化”学科硕士点；1991年，生物化学学科单独建硕士点，本学科改名为植物生理学科；1997年，再次调整为新的植物学学科；1998年经国家学位委员会审核批准，建立了植物学博士点。
1996年，本学科被评为山东省普通高校“九五”重点建设学科，经五年的投资和建设，学科实力大大增强，已于2001年5月通过山东省教育厅组织的验收，被评为优秀。
本学科自1979至2001年，共招收硕士研究生22届112人，博士研究生32人，目前在校研究生规模已达60人。在研究生培养中，严格贯彻质量第一的原则，使绝大部分研究生毕业后取得了显著成绩，成为各用人单位的骨干，“九五”期间毕业的博士生中有5人被评为教授，9人被评为副教授。
经过多年的研究与积累，本学科已形成光合作用过程及分子调控、植物抗逆性及其分子基础和植物发育分子生物学三个稳定的、具有特色的研究方向，每个方向均有一批学术思想活跃、业绩突出的中青年教授和副教授作为学术带头人和学术骨干。
“九五”期间，在重点学科建设经费的支持下，本学科新购价值255.2万元、具有90年代末世界先进水平的仪器设备，承担和完成大量国家级科研课题，其中包括：国家转基因植物研究专项2项，国家攀登计划3项，国家九七三项目3项，国家自然科学基金6项。
自90年至今，出版专著6部，发表论文120余篇，克隆了具有自主知识产权的基因20个，构建了4个基因文库；高等植物花发育的分子生物学研究成果被收入国际权威教科书；获各种科技奖励20余次，其中国家发明二等奖1次，国家科技进步二等奖1次，国家教委科技进步一等奖1次、三等奖1次，山东省科技进步二等奖3次，山东省科技进步三等奖2次。
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