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生物反应器工程国家重点实验室于1989年批准立项，1996年正式对外开放。2001年和2006年两次通过国家评估，并取得良好的成绩。
实验室主要从事生物反应器工程学的基础与应用基础研究，主要分为三个研究方向：生物过程工程、生物反应工程、生物系统工程。研究内容涉及工业发酵与代谢工程，生物催化与酶工程，动植物细胞大规模培养、组织工程及生物材料，海洋生物技术，生物质转化技术等热点课题。
实验室依托于华东理工大学。学术委员会主任为杨胜利院士，副主任为张嗣良教授和钟建江教授；现任实验室主任为许建和教授副主任为谭文松教授、鲍杰教授、叶邦策教授和陈长华教授。现有固定研究人员50人，其中教授26人，博士生导师21名，4人获得国家杰出青年基金、4人被聘为教育部长江学者特聘教授、2人入选国家新世纪百千万人才计划、7人入选教育部跨世纪/新世纪优秀人才计划，还有2人分别担任国家973计划首席科学家和863计划领域专家。
2001-2005年间，实验室主持或参加了包括国家高技术研究发展计划（863）、国家重点基础研究发展计划（973）、国家自然科学基金、国家科技攻关计划等一大批科研项目，获得各类竞争性研究经费资助8700多万元。实验室获得国家科技进步奖 2项，省（部）级科技一等奖 4项，二等奖 3项，三等奖4项，国际学术奖2项。完成中文专著14本，国外学术专著2本/专著章节4个；获国家发明专利授权41项。培养博士研究生115名、硕士研究生300余名。2001-2005共发表SCI论文260篇，被SCI引用546次；2006和2007年发表SCI论文各110篇，被引用300和380次。
实验室鼓励、支持国内外的科研人员来实验室开展合作研究工作， 7年来共批准开放课题共32项。实验室重视国内外学术交流，五年中共在国内外学术会议作大会或特邀报告50余人次，来实验室访问交流或做学术报告的有530余人次，对提高实验室的研究水平，扩大国际影响起到了良好作用。
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