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中国科学院昆明植物研究所（以下简称昆明植物所）位于云南省昆明市黑龙潭风景区，其前身是成立于1938年的云南省农林植物研究所，1950年4月隶属中国科学院并更名为中国科学院植物分类研究所昆明工作站，1959年4月由国家科委批准成为中国科学院昆明植物所。现任所长为李德铢研究员。我国老一辈植物学家胡先骕、严楚江、郑万钧、汪发瓒、俞德浚、蔡希陶、陈封怀、吴征镒等先生都先后在所内工作过，2007年，昆明植物所名誉所长吴征镒院士获得国家最高科学技术奖。
昆明植物所以“原本山川极命草木”为所训，旨在认识植物、利用植物、造福于民。研究所立足云南和我国西南，面向东南亚和喜马拉雅，以植物多样性和植物资源为研究对象，通过多学科的创新和集成，为我国植物科学的发展、生物多样性保护、生物资源持续利用和生物经济发展做出重大贡献。根据中央建设创新型国家和西部大开发的战略部署，我所将建设成为具有强大科技创新和持续发展能力、特色鲜明的国立研究所，成为我国知识传播和高级生物学人才培养基地之一，成为西南地区天然药物产业化孵化基地之一。
昆明植物所为全额拨款事业单位，现有在职员工383人，其中有中国科学院院士3人，国家杰出青年科学基金获得者8人，中国科学院“百人计划”入选者16人，副高及以上研究人员107人，其中博士生导师34人，硕士生导师28名。研究所从1979年开始招收硕士研究生，1986年起开始招收博士研究生，现有植物学、药物化学两个学科的博士学位授予点，和植物学、微生物学、生物化学与分子生物学以及药物化学的硕士学位授予点。昆明植物所是“云南省植物学会”的挂靠单位，负责主办学术期刊《云南植物研究》。
昆明植物所已建成具有先进水平的科技信息、仪器分析测试、标本馆、种质资源库以及植物园等重要科技支撑条件。设有“两室一园一库”（即生物地理与生态学研究室、植物化学研究室、植物园和中国西南野生生物种质资源库），拥有植物化学与西部植物资源持续利用国家重点实验室、国家大科学工程中国西南野生生物种质资源库、中国科学院生物多样性与生物地理学重点实验室。与世界混农林业研究中心共建“国际山地生态系统研究中心”、与英国爱丁堡植物园共建“保护生物学联合实验室”、与著名国际化妆品公司Mary Kay共建“个人护理品联合实验室”。种质资源库已收集保存野生植物种质资源12000余份，植物标本馆藏有种子植物、孢子植物标本120余万份。目前，研究所的工作总目标是围绕四大学科领域，即植物进化生物学、植物化学和化学生物学、植物基因组学以及保育生物学等方面开展原创性的研究，形成新的研究体系和研究格局，成为国际上在植物多样性、植物资源研究和生物技术产业领域具有重大影响的研究机构，为我国生物技术产业、环境保护和经济社会的可持续发展提供原创性的科研成果。在新药研发方面，主要是利用我国丰富的生物资源和民间民族利用药用植物的经验，开展治疗肿瘤、心脑血管、神经系统、艾滋病等重大疾病的天然药物和民族药物开发研究。迄今为止，先后有50余项应用性成果实现了产业化生产，其中，包括天麻素、宫血宁、草乌甲素、神衰果素片、青阳参片、鞘蕊苏口服液等新药，这些成果在云南、四川、河南、贵州等省的二十多家药厂得以应用生产，年均产值达数十亿余元。而且，抗艾滋病新药“复方SH”已经转让，抗心血管疾病新药“灯盏细辛酚注射液”完成三期临床研究，抗早老性痴呆一类新药“芬克罗酮”完成一期临床研究，一类中药材及二类新药“CHY胶囊”完成临床前研究。在花卉新品种研制方面，主要开展野生花卉资源的遗传背景、繁育机制、生态生理和发育的分子机理研究，为具有自主知识产权的新品种选育和花卉产业发展提供技术支撑，近年来，研究所先后选育出42种有自主知识产权、地方特色的花卉新品种，并完成新品种注册登记，完成具有云南特色和自主知识产权的角蒿、地涌金莲、滇丁香等6个品种的繁殖技术，有8个植物新品种获得国家正式登记和批准。此外，研究所以花卉技术参股企业云南绿大地生物科技股份有限公司已成功上市，是科研成果转化和产业化开发工作中的一个成功范例，也是研究所科技工作面向当地国民经济建设和社会发展的有力见证。
党和国家领导人如周恩来、朱德、邓小平、李先念、胡锦涛、朱镕基、习近平等曾先后亲莅研究所视察和指导工作。2006年5月14日，中共中央总书记、国家主席胡锦涛同志视察昆明植物所时，曾高度评价了昆明植物所老一辈科学家的历史功绩，同时也勉励研究所在生命科学、生物产业和生物多样性保护与持续发展中继续发挥引领和骨干作用。
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