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中山大学海洋学院于2008年6月成立。学院建设以立足南海，面向国家和地方在海洋科学的深海生物资源、矿产资源和近岸海洋工程与环境领域的重大科技需求，围绕资源与环境、资源与发展二大主题，重点开展我国深海生物功能基因资源、海洋生物资源保护、海洋地质矿产资源、海洋环境、海洋工程、海洋监测和海洋矿产资源基础与应用基础科学研究与技术开发。
学院教职工队伍现有教授（研究员）41名（包括31名兼职教授），副高职称8名，讲师14名。与生命科学学院、环境学院和地球科学系等学院（系）共建核心团队8个。现有高级职称人员中有国家基金杰出青年科学基金获得者2名，珠江学者1名，教育部新世纪优秀人才1名，中山大学二级教授3名。
学院现已招收海洋生物资源与环境专业08级、09级本科生和海洋科学专业10级本科生241人，2010年开始独立招收硕士研究生22人，博士研究生5人。四年内本科生规模将达到360人左右，研究生规模达到120人左右。学院还拥有海洋科学博士后流动站，现已接收8名博士后进站工作。
学院注意培养学生的实践能力，除制定了较为系统的实验课和野外实习课外，学院积极利用社会教学科研力量，目前已与国土资源部广州海洋地质调查局、国家海洋局南海工程勘察中心、广州航道局有限公司以及恒兴、国联等水产公司建立联系，为学生提供专业实习基地，共同培养学生。
学院在珠海校区和大学城东校区拥有良好的教学、科研工作条件和环境，拥有广东省海洋资源与近岸工程重点实验室、水产品安全教育部重点实验室（与生命科学学院、测试中心、公共卫生学院联合筹建）、广东省河口水利工程实验室（与广东省水利水电科学研究院共建）、海洋石油勘探开发广东高校重点实验室、中山大学近岸海洋科学与技术研究中心、中山大学河口海岸研究所、海洋地质研究所和深海生物资源研究所等研究机构。
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