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计算机科学系于2001年成立挂靠在数学系,2002年独立建系,2006年更名为计算机科学与工程系,下设计算机体系结构、计算机软件与理论、计算机应用技术、信息管理技术等4个教研室和1个计算机教学实验室建设。
计算机科学与技术专业2000年招收首届本科生,2004年获得学士学位授予权,现按计算机科学与技术、计算机科学与技术(师范类)和计算机科学与技术(软件工程)3个方向招生,共有在校生1208名。信息管理与信息系统专业2005年招收首届本科生,现有在校生276名。2006年“计算机应用技术”增设为硕士学位授予点,2007年首次招生。
计算机科学与技术专业为校级特色专业,计算机教学实验室建设为校级实验教学示范中心,计算机软件与理论教学团队为校级教学团队,“离散数学”为省级精品课程、“数据结构”为校级精品课程。计算机应用技术为省级重点建设学科,并建有信息安全与计算机网络福建省高校重点实验室。
我系拥有一个省级重点学科、院级重点建设学科——计算机应用技术,该学科支撑我系本科专业:计算机科学与技术,计算机科学与技术(师范),信息管理与信息系统。

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