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福建医科大学药学院于2000年4月开创药学本科教育，是一个具有全日制与成人教育等多种办学形式，学士-硕士-博士等多种人才培养层次，已形成具有一定规模和影响，集教学、科研、开发与社会服务为一体的高等药学教育机构。设有药理学系、药物分析学系、药物化学系、药剂学系、天然药物学系和基础化学系6个学系，以及1个省级药学实验教学示范中心，拥有临床药理研究所、蛇毒研究所和新药研究所3个校级新药研究机构。
一、雄厚的师资力量
药学院现有教职员工88人，其中教授10人，副教授及副高级职称18人，博士生导师4人，硕士生导师17人，教师中具有博士学位者20名。目前师资队伍中有4名教授为留学归国学者，引进高级人才5人，享受国务院特殊津贴专家2人，入选福建省“百千万人才工程”4人，全国高校优秀骨干教师1人。药学院教授在药学领域享有较高的知名度，在全国性学术学会担任了中国药理学会理事、中国药理学会肿瘤药理专业委员会副主任委员、中国药理学会神经精神药理专业委员会委员等重要学术职务。
二、突出的办学特色
现设有药学和药物制剂2个本科专业，其中药学本科专业为国家级特色专业建设点，拥有药理学博士学位授权点和药学一级学科硕士学位授权点，以及福建省高校药理学重点学科。目前在校全日制本科生数达1000余人和博硕士研究生100余人，为医药行业培养输送了本科学生1262人和博硕士研究生155人的药学专业人才。学院具有《药理学》、《药物分析》、《分析化学》和《卫生化学》等4门省级精品课程，《药理学》1门省级优质硕士课程，1个省级药理学教学团队，以及省级应用型药学人才培养模式创新实验区和省级药理学研究生教育创新基地。药学院根据专业科学发展和人才市场的需要，设有科学的实习内容和规范的实习单位，注重培养学生动手能力及实践操作能力，全面提高学生综合素质和择业就业的抗风险能力，近年来，药学院本科生就业率达96.5%以上。
三、良好的办学条件
近年来，学院以福建省重点高校建设为契机，加强对实验室建设的投入，购置了较为先进的教学科研仪器设备，较好地改善了教学科研条件。获批建立了的中央与地方共建药理学毒理学基础实验室、福建省高校天然药物药理学重点实验室、福建省生物医药工程研究中心、福建省中药药理重点研究室、国家中医药中药药理科研三级实验室以及福建省药物非临床安全性评价中心等部、省重点实验室，现学院实验室面积近5000 平方米，配备有高效液相-质谱联用仪、红外光谱等大型贵重仪器设备，5万元以上仪器设备22台，仪器设备总价值达1500万元，形成了一个集药物化学、药理学、临床前评价为一体的开放式、综合性、现代化的新药研究创新平台。
四、良好的科研发展基础
药学院以稳定的研究方向显示出强劲的科研实力，近年来，药学院在新药研发方面已形成了明显的特色和优势，重点构建了抗肿瘤药物研究、神经精神药物研究、生物肽生化药理研究、纳米生物传感器研究等稳定的研究方向，其中姜黄素抗癌作用的分子机理，褪黑素镇痛和抗吗啡依赖作用及其中枢机制，生物传感器在药物分析和疾病诊断的基础与应用研究等研究领域取得突破性进展，得到国内外同行的好评。目前正在开展国家1类抗癌新药临床前研究2个；获得具有开发成1类新药苗头的药用活性物质20多个。
近5年来，获得省科技进步二等奖3项，三等奖3项，国家专利授权2项；累计发表科研论文300余篇，SCI源期刊收录论文50余篇；获得包括国家863计划项目、国家自然科学基金在内的62项国家、省（部）级科研课题。药学院还成功承办了“第七届全国肿瘤药理与化疗学术会议”、“第十一届全国神经药理学术会议”和“第七届全国生物毒素学术会议”大型全国性学术会议，以及2009医学前沿论坛暨第十一届全国肿瘤药理与化疗学术会议审稿会，扩大学院的影响，增强了与国内外同仁的交流合作，受到同行专家教授的高度赞誉。
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