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吉林大学第二医院是卫生部部管，教育部部属大型综合性教学医院，原名白求恩医科大学第二临床学院，创建于1948年，其前身是始建于1936年的伪满洲国新京特别市立医院，栉风沐雨几度更名，于1978年8月正式定名为白求恩医科大学第二临床学院。2000年6月五校合并改名为吉林大学第二医院。
医院占地面积65725平方米，建筑面积115863.6平方米。2008年门急诊量达70万人次，住院病人近5万人次，其中手术病人2.2万人次。医院医疗、科研力量雄厚、人员梯队合理。每年承担国家、卫生部及省市重大科研课题近百项，而且还承担吉林大学临床医学专业、妇幼卫生专业、口腔医学专业本科生和成人教育学院、护理学院等学生的临床教学任务，现有具有高级职称医护人员253人，有96名硕士生导师，27名博士生导师。2006年——2008年共发表科技学术论文1815篇，其中被SCI收录的科技学术论文37篇；纵向课题191项，其中国家自然科学基金13项，“863”子课题1项，“973”子课题1项；横向课题33项。医院现设有38个临床科室，12个医技科室，15个教研室，拥有病床1740张。吉林省呼吸病研究所、吉林省围产医学研究中心等10余个省级研究中心均设在二院，以其精湛的医疗技术，担负着全省的医疗会诊任务。是卫生部临床药理基地和卫生部国际紧急救援中心网络医院。
医院的仪器设备不断更新，有国际领先的核磁共振机、数字减影机、64排螺旋CT机、眼科准分子激光曲光系列矫正仪、全国领先的NT系列内镜图像显示仪、彩色多普勒、眼科玻璃体切割机、激光视网膜脉络膜造影系统、全自动生化分析仪、直线加速器、钴60 放射治疗机等大型仪器设备300余台件。
妇产科、眼科、皮肤科、基本外科及耳鼻喉科是吉林省、吉林大学重点临床科室；心血管外科完成的世界首例冠状动脉右室瘘的瘘口修补加右冠状动脉成形术和国内首例双极射频消融改良MazeⅣ手术治疗房颤的病例，均达到了世界先进水平，在吉林省内完成首例本省医生主刀的心脏移植手术：一期完成主动脉瓣和二尖瓣膜置换，三尖瓣膜成形，心房血栓清除，冠状动脉搭桥及双极射频治疗房颤的复杂手术治疗。在吉林省内率先独立开展冠脉搭桥手术，包括常规体外循环下冠脉搭桥术，非体外循环心脏跳动下冠脉搭桥术等等。此外，呼吸内科、泌尿外科、心血管内科、胸外科、皮肤科、耳鼻喉科、脑外科等多项治疗技术水平均达到了国内领先水平，为吉林省医疗水平的发展做出突出贡献。
改革开放以来，多次接收日本、美国、加拿大、韩国等研究人员来院学习中医、针灸技术，并不断向美国、日本、韩国、俄罗斯、奥地利、澳大利亚等国家派出专业人员研修、考察，同时邀请了一些国外学者来院讲学、访问，并聘请名誉教授、顾问等多人，并与韩国延世大学Severance医院结为友好医院，加强了学术交流和友好往来。
1993年9月医院通过了卫生部检查团的检查验收，为吉林省内综合医院首家国家级爱婴医院，1994年4月又进入卫生部三级甲等医院行列。2004年在中华医学会举办的“让患者明明白白看病，争创百姓放心医院”活动中被评为首批“全国百姓放心示范医院”。多年来，多次荣获国家及省市校各级荣誉称号百余项，2008年被中国卫生思想政治工作促进会评为全国卫生系统思想政治工作先进单位穿越岁月的长河，历经六十余年的洗礼。吉林大学第二医院凝心聚力，秉承优良传统，以科学发展观为统领，以高质量的医疗水平和良好的医德医风努力服务社会、服务人民。站在新的起点，吉林大学第二医院将用手中绚丽的画笔在未来发展蓝图上书写更加华美的篇章！
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