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1999 年成立环境工程系， 2004 年 7 月成立市政与环境工程学院。现设有给水排水工程、环境工程和生物工程三个本科专业；给水排水工程教研室、环境工程教研室、化学教研室和生物教研室四个教研室；市政与环境工程实验中心、化学实验教学中心和给水排水工程综合实验室（省级重点实验室）三个实验室（中心）；市政工程和环境工程两个硕士学位授权点，建筑与土木工程领域在职申请硕士学位授权和工程硕士授权。
给水排水工程综合实验室为山东省高校重点实验室，在“十五”和“十一五”期间，均被批准为省级重点实验室。市政工程学科为校级强化重点建设学科。 2007 年给水排水工程专业被评为山东省特色专业和山东建筑大学品牌专业。 2008 年给水排水工程专业以“优秀”成绩顺利通过国家专业教育评估。“十一五”期间，山东省城市污水处理与资源化工程技术研究中心以“优秀”成绩 顺利通过山东省专项评估。毕业生就业率始终保持在 90% 以上。
学院现有教职工 75 人，其中教授 11 人（含研究员），副教授 22 人；博士生导师 1 人，硕士生导师 26 人（含外聘导师 6 人）；教师中具有博士学位及在读博士人员 28 人，具有硕士学位人员 27 人，外聘院士 2 人。全日制在校本科生 1290 人，研究生 83 人。
“十一五”以来，学院先后承担国家科技攻关、国家自然科学基金、国家科技重大专项“黄河下游地区饮用水安全保障技术研究与综合示范”项目、山东省自然科学基金项目、山东省中青年科学家基金、山东省科技攻关、教育厅科技攻关、济南市科技攻关等研究项目 40 余项。完成了科技开发项目 20 余项。先后获山东省科技进步二等奖 2 项、三等奖 6 项、建设部科技进步三等奖 1 项，山东高校省级优秀实验技术成果一等奖 1 项，山东省冶金科技进步一等奖 1 项，山东省高校优秀科研成果二等奖 1 项、三等奖 3 项，发表学术论文 300 多篇， sci 、 ei 收录 40 余篇，编制国家标准 2 部，出版各类专著及教材 10 余部。
学院将以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，认真落实科学发展观，坚持社会主义办学方向，以高等教育法为依据，紧密围绕学校党委确定的中心工作，全面落实学校党代会提出的战略任务，解放思想，改革创新；结合学院实际，坚持“质量立院、科研兴院、人才强院”战略，在教学、科研、学科专业建设、师资队伍建设、实验室建设、学生培养和管理体制改革等方面实现较大发展；配合学校教学管理体制的改革，完善学院各项运行机制，坚持突出工程特色、密切结合区域经济发展的学科专业建设方向，坚持内涵建设，建设特色鲜明、各学科协调发展的市政与环境工程学院。
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