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一、培养目标
培养具有较高政治理论水平和人文素质修养，树立辩证唯物主义与历史唯物主义的世界观，身心健康，具有较强的事业心和为科教兴国无私奉献精神的高水平专业人才。硕士学位获得者应掌握坚实的基础理论和系统的专门知识，具备独立从事微生物学领域的教学、科研和管理工作的能力。较为熟练掌握一门外语，能够阅读本专业的外文资料。熟练运用计算机进行信息收集和数据处理。
二、研究方向
1．微生物资源与利用
2．微生物代谢产物
3．应用微生物
三、学习年限
非在职学习研究生在校学习研究的最低年限为3年。在职学习研究生最低学习研究的年限为4年。因特殊原因不能按期完成学业者，应在毕业前一年的12月上旬提交延期学业的申请报告，经导师和学院主管研究生工作的院长同意，报研究生部审批，报告批准方可延期毕业。
四、课程设置
硕士研究生课程设置为学位课和选修课两类。实行学分制，硕士研究生课程学习至少应获得30学分，一般不超过40学分。教学实践2学分。
课程设置如下：
（一）学位课（19学分）
1．政治理论课（3学分）
科学社会主义理论与实践1学分
自然辩证法2学分
2．外国语课（5学分）
基础外语4学分
专业外语1学分
3．专业基础课（9学分）
分子生物学3学分
微生物生理学3学分
微生物遗传育种3学分
4．专业课（2学分）
现代微生物学专题2学分
（二）选修课（不少于12学分）
1．在导师指导下选修，可包括2-3门相关专业的硕士研究生基础课程
2．基因工程原理与技术2学分
3．微生物生态学2学分
4．环境微生物学2学分
5．发酵微生物学2学分
6．菌根学2学分
7．细菌学2学分
8．真菌学2学分
9．病毒学2学分
10．微生物资源学2学分
五、学位论文工作
学位论文工作是研究生培养的重要组成部分，是对研究生进行科学研究或承担专门技术工作的全面训练，是培养研究生创新能力，综合运用所学知识发现问题、分析问题和解决问题能力的主要环节，应鼓励硕士生参与导师承担的科研项目，注意选择有重要理论意义或应用价值的研究课题，学位论文要有新见解。
硕士学位论文应是系统完整的学术论文，应达到国内或国外重要学术刊物发表的水平。研究生论文一般应是导师主持科研究项目的一部分，选题在导师指导下由硕士生拟定，并在广泛阅读文献资料和进行必要调查的基础上，写出开题报告，由本学科点组织相关的教授、专家进行开题论证会，就选题的科学依据、研究内容、实验方法、预期目标等做出论证，开题报告前应充分查阅国内外重要学术论文。开题论证后至少18个月方可进行论文答辩。
在学习期间，导师应定期检查硕士生试验研究进展及相关的论文撰写等情况，硕士生也应定期主动向导师汇报学习、学位论文研究工作等情况。倡导以学院、学科点或研究室为单元定期举行学术报告会（seminar），加强研究生在学院、学科点或研究室内部的相互交流。
硕士生论文初稿应经导师指导小组仔细审阅，对取得的试验结果认真进行核对，对论文要多次修改，如发现论文数据有虚假现象，应及时制止撰写，以保证论文质量和学术水平。如导师在论文修改过程中敷衍了事和不认真而出现质量问题，导师应负主要责任。硕士学位论文应首先在指导小组或学科点内进行预答辩，合格及进行充分修改后方可进行正式答辩。
六、培养方式与方法
本专业硕士研究生课程学习不得少于30学分，学位课70分及以上者为合格，选修课考试成绩60分级以上者为合格。公共学位课按学校统一要求开设，专业课采取教师讲授加学生讨论或教师指定教材、学生自学加教师辅导或教师作专题讲座加学生写读书报告等多种方式进行。
七、思想品德教育
学院党政组织、导师和任课教师要切实加强对研究生的思想品德教育，帮助研究生树立正确的世界观和人生观。积极参加社会实践、公共活动和公益劳动。导师要坚持教书育人，培养研究生具有良好的科研道德修养，工作中能团结协作，达到攀登科学高峰和勇于献身的精神境界。
八、其它考核要求
1．外语6级：要求硕士研究生毕业前通过国家外语6级考试。
2．中期考核：研究生向中期考核专业小组汇报入学以来的思想情况，业务学习、开题、论文进展情况以及存在的问题。将有三门学位课考试成绩在75分及其以下者或曾有一门学位课补考或第一次论文开题未通过者列为跟踪培养对象，从中期分流开始，对其课程学习、开题论证、论文送审、答辩等环节进行重点检查，必要时推迟6-12个月申请论文答辩。对考核不合格的研究生报学校中期考核分流领导小组处理。
3．发表论文：参照《西北农林科技大学研究生申请学位论文答辩前学术水平基本要求暂行规定》执行。
4．学术报告：要求硕士研究生在校期间积极参加学院、学校以及国内外举办的各种学术报告和交流活动。硕士研究生参加的学术报告会要有必要的记录，一般参加次数不少于8次。
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