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安徽医科大学为省属重点大学。前身是1926年5月创办于上海的私立东南医学院。1949年底响应中共中央华东局“面向农村，走向内地”的号召，内迁安徽省，成为安徽省第一所高等医科院校。1952 年改名为安徽医学院。1996年6月经国家教委批准，更名为安徽医科大学。学校位于安徽省会合肥市，校园环境优美，交通便利。
学校坚持规模、结构、质量、效益协调发展，教育质量不断提高。学校的办学定位是建设高水平教学研究型医科大学。学校将现代著名教育家蔡元培先生为学校前身东南医学院师生的题词“好学力行，造就良医”确立为校训，弘扬“爱国爱民，献身人类健康”的光荣传统，秉承“兴国、奉献、仁爱”的育人理念，倡导践行“求真、求精、求新”的校风学风。
学校现有基础医学院、公共卫生学院、口腔医学院、卫生管理学院、药学院、护理学院、生命科学学院、人文社会科学学院、公共基础学院、研究生学院、国际教育学院、成人教育学院（继续教育学院）等25个直属教学机构。
学校拥有4所直属附属医院（第一附属医院、第二附属医院、第四附属医院、附属口腔医院——安徽省口腔医院）、6所非直属附属医院（附属省立医院、第三附属医院——合肥市第一人民医院、附属合肥医院——合肥市第二人民医院、附属安庆医院——安庆市立医院、附属六安医院——六安市人民医院、附属巢湖医院——巢湖市人民医院）。学校坚持开放、合作、共赢的方针，与中国人民解放军军事医学科学院建立战略合作伙伴关系，并在解放军北京军区总医院、空军总医院、海军总医院、武警总医院、306医院、307医院、新疆自治区人民医院等建立临床学院，目前临床学院达40余所，各专业实践教学基地100余所，分布于安徽省各地市及北京、上海、江苏、山东、浙江、广东、福建、新疆等省市区。
学校设有临床医学（七年制）和临床医学（五年制）、口腔医学、预防医学、生物技术、护理学、卫生事业管理、药学、中药学、医事法学、食品质量与安全等30个本科专业（方向）。拥有临床医学、药学2个博士学位授权一级学科点，共27个博士学位授权学科点，拥有临床医学博士专业学位授予权，有9个硕士学位授权一级学科点，74个硕士学位授权学科点。建立了药学、临床医学、公共卫生与预防医学3个博士后科研流动站。皮肤病与性病学为国家重点学科，病理科为国家临床重点专科，中药药理学为国家中医药重点学科，有19个省级重点学科，42个省级临床医学重点学科和重点扶持学科；建有1个科技部省部共建国家重点实验室培育基地，2个教育部省部共建重点实验室、13个中央（财政部）与地方共建实验室，22个省级以上（重点）实验室（工程技术中心、科技公共服务平台），是国家药品临床研究基地。有2个安徽省科技创新团队，1个安徽省“115”科技产业创新团队。《流行病学》、《临床药理学》是国家级精品课程，预防医学、药学、临床医学、公共事业管理专业是国家级高等学校特色专业建设点，临床药理学教学团队为国家级教学团队。获得国家级教学成果二等奖一项。
在校生共16673人，其中博士生179人、硕士生2728人、普通本科生13671人。另有留学生、港澳台研究生95人、成人教育学生7187人。
在职教职医护员工3733人，专任教师队伍中具有博士、硕士学位的教师占78.8%，博士生导师127人，硕士生导师913人，3人担任国家级专科学会主任委员（中华医学会皮肤性病专业委员会、中国药理学会临床药理专业委员会、中华预防医学会卫生事业管理分会），7人入选国家“百千万人才工程”第一、二层次人选，有教育部骨干教师2人，卫生部突出贡献中青年专家5人，“皖江学者”特聘教授2人，教育部高校医药学科指导委员会专家5人，省学术技术带头人及后备人选、省卫生系统学术技术带头人127人，省高校学科拔尖人才12人，省高校优秀中青年骨干教师29人，享受国务院及省政府特殊津贴201人。学校聘请20位海外教授，组建“海外兵团”，广泛吸纳高层次人才。
近5年来，学校共承担“863”、“973”计划、国家科技支撑计划和国家自然科学基金项目等192项。国家自然科学基金立项数近年来保持安徽省属高校领先地位。近年来获国家科技进步二等奖一项、高校自然科学技术奖一等奖一项、中华医学科技奖一等奖三项、中华医学科技奖医学科普奖一项。2009年度，我校发表论文全国高校排名第44位，全国医药类高校排名第12位，国内论文被引全国高校排名第66位。先后以责任作者单位在《新英格兰医学杂志》、《自然遗传学》等国际著名SCI刊物发表多篇高水平研究论文，在复杂疾病易感基因研究上居国内领先水平。我校张学军教授研究组利用全基因组关联研究发现银屑病、白癜风和麻风病易感基因的研究成果被评为2010年度中国科学十大进展之一。
学校成立了临床药理、皮肤病、卫生事业管理等65个省、校级研究所。编辑出版的国家级及面向全国发行的期刊有《安徽医科大学学报》、《中国药理学通报》、《临床与实验病理学杂志》、《中华疾病控制杂志》等15种。学校藏书86万余册，中外文印刷期刊及网络电子版期刊30余万册，为全国生物医学文献资源共享网络安徽省级中心馆。
学校同德国、瑞典、美国、加拿大、日本、韩国以及台湾、香港地区的高等院校开展了密切的交流，双方互派专家学者、互派学生、相互交流信息资料、共同开展科研合作。
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