药物化学硕士点为2006年新增硕士点，本学位点以药物化学、天然药物化学、基础化学等学科为依托，师资力量雄厚，有教授4人，副教授11人，讲师7人；其中博士1人，在读博士2人；硕士研究生16人，在读硕士研究生5人，具有老、中、青专家梯队。本学科已成为安徽省药物合成工艺研究的最重要基地，为制药行业培养高素质的药物合成人才。

　　主要研究方向：1、药用材料和纳米制药；2、药物设计及合成工艺研究；3、天然药物活性成份现代分离技术和结构修饰与改造。

　　在药用材料和纳米制药研究方面，一直从事于新型高分子材料的合成及高分子材料在药物生产中的运用。将药用新材料、新技术用于药物生产新工艺和药物新剂型的研究，通过研制新材料制作分离膜，用于中药材浸提液中活性成份和活性部位的分离与提取，鉴于中药水提液成分的复杂性，本方向侧重于抗污染分离膜的研制，利用材料的双亲性特点研制纳米级药物及药物的纳米分散体。承担了省“十五”科技攻关课题“中药材生物碱的膜法分离”、省自然科学基金课题 “中药材小分子有机药物分离膜的研制”等多项科研课题。

　　在药物设计及合成工艺研究方面，一直致力于药物合成、中药活性成分结构修饰和药物合成工艺的研究，尤其注重于药物合成工艺的改进和创新研究、手性药物不对称合成方法的研究和药物合成路线的合理设计及优化。承担了国家中医药管理局“修饰岩白菜素的化学结构延长半衰期提高疗效的实验研究”、安徽省教育厅“新莪术二酮的提取、分离、鉴定和相关药效学作用初步研究”和“芦根多糖的提取纯化和保肝作用及机制的研究”等科研课题。

　　在中药有效成分的提取、合成和结构改造方面成果明显，利用化学合成法制备出益母草的主要有效成分益母草碱，完成了Ⅰ类新药的药学资料。在研究中药葛根等有效成分的基础上，研制成抗糖尿病新药“糖人康”。在研究叶绿素的基础上，结构改造得到叶绿素锌，创造出有价值的新品种。由中药藤黄提取出的有效成分—新藤黄酸，通过对其结构修饰后制备而成的抗肿瘤药（为中药一类新药），工艺先进，提取收率和产品纯度高，达到国内外先进水平。承担了安徽省科技厅重点项目“一类新药—新藤黄酸及注射用新藤黄酸原料药、冻干剂的临床前研究”、安徽省科技厅“国家一类新药注射用新藤黄酸冻干粉针剂的研制”和安徽省教育厅“瓜蒌皮水溶性成分研究” 等科研课题

　　近五年来共发表论文65篇，其中被国外权威期刊索引收录5篇；获国家级奖3项，省部级奖3项，出版教材10多部，其中《制药工艺学》为主编单位。