学制三年。主要开设课程有英语、计算机应用、医用统计学、科研方法学、文献检索、实验动物学基础、内经、伤寒论、金匮要略、温病学、中西医结合医学概论、细胞生物学、神经解剖学、神经生理学、生物化学概论、分子生物学及其技术、临床病理生理学、医学免疫学、中药药理学、中西医结合基础研究进展、中西医结合临床研究进展等课程。要求研究生具有全面、系统、深入、扎实的中医基础理论知识和西医基础理论知识，包括中西医临床知识和技能，具备从事中西医结合医学科学研究和一定教学工作的能力，具有较高的英语水平。研究生在读期间跟从导师从事教学实践、科研工作和临床医疗实践，毕业可授予医学硕士学位。研究生毕业后能从事教学、科研、医务行政管理工作和临床医疗工作。