吉林大学原子与分子物理研究所是由国家教育部1979年批准设立的自然科学研究机构，现有原子与分子物理和凝聚态物理两个国家重点学科，其中凝聚态物理学科于1992年经国家计划委员会批准建立了超硬材料国家重点实验室。从建所初期开始，在芶清泉教授等老一辈科学家带领下，确定了以研究高
温高压下物质的结构、性能和变化规律，极 端条件下的原子分子状态结构、运 动规律，以及高温高压下新材料合 成为主的研究方向，经过30年发展， 在相关领域已经成为我国主要的科学研究和人才培养基地。
吉林大学原子与分子物理研究所是我国最早的原子分子物理学研究生培养基地。1978年恢复研究生教育后，以芶清泉教授为首的指导教师组招收了首批原子与分子物理硕士研究生（共计12人），国务院学位委员会于1981年和1983年先后首批批准吉林大学原子分子物理研究所为原子与分子物理学和凝聚态物理硕士和博士学位授权点。1984年美国学者K．T．Lu受聘于吉林大学，开始原子分子物理学博士研究生培养工作。1986年在国家评审中吉林大学凝聚态物理学科成为首批国家重点学科，2001年原子与分子物理学科通过评审被批准为国家重点学科。
伴随着伟大祖国改革开放和建设有中国特色社会主义事业日新月异的发展，吉林大学原子与分子物理研究所已走过近年的发展历程，形成了若干长期和比较稳定且具有自身特点的研究方向和研究基础，有着一支整体学术水平较高、实力强的学术队伍，己成为我国原子与分子物理与凝聚态物理人才培养和科学研究的主要基地之一 。
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