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化学化工学院的前身是吉首大学1960年成立的理化组、1973年成立的化学科、1986年成立的化学系，是于2003年4月由原生命科学与化学学院的化学专业和食品科学与工程专业重组而成，是吉首大学创建最早的全日制院系之一，是湖南西部化学化工和食品科学领域的人才培养、科研与开发的重要基地，是吉首大学理工结合，学科面较广，规模较大，在省内外有一定影响和特色的学院。
学院现设有化学系、化工系和食品科学与工程系等3个系，以及化工研究所、新材料和应用电化学研究所、食品科学研究所和分析测试中心、湘西州高新技术创业服务中心等5个研究所（中心），共有化学（师范）、应用化学、化学工程与工艺、食品科学与工程等4个全日制本科专业，专业涵盖理学、工学两大学科门类，其中，食品科学与工程专业为省级重点专业，食品科学和应用化学学科为校级重点学科，拥有应用化学和分析化学学科两个硕士点。
学院拥有一支学历、职称和学科结构比较合理，思想活跃，水平较高，富有创新和奉献精神的师资队伍。有教职工50人，其中教授10人，副高以上职称18人（不含教授），具有博士学位9人，在读博士3人。学院还聘请了校内兼职教授3名，校外特聘教授4名，校外客座教授3名，先后有14人担任硕士生导师，入选湖南省青年骨干教师6人。学院面向全国30个省（市）招生，现有全日制本科学生750余人。学院近几年各专业学生就业率为100%，应届毕业生考研录取率连续多年居全校前列。
学院教学科研设施比较齐全。在充分共享吉首大学网络系统、图书资料及其他各种教学资源的基础上，还拥有建筑面积近6000平方米的办公、教学、科研用房和藏书3600余册、中外期刊70余种的院资料室，设有基础化学实验室（含无机化学、有机化学、分析化学、仪器分析、物理化学等实验室）、化工专业实验室（含化工原理、精细化工、工程制图及计算机模拟等实验室）、食品科学与工程专业实验室（含食品工艺、发酵工程、食品分析等实验室）、分析测试中心等4个教学实验室，面积近4000平方米，实验仪器设备总值达1000余万元，教学科研仪器设备1700余台（件），其中基础化学实验室于1997通过了省级“双基”评估，2006年确定为省级示范实验室，分析测试中心于1999年通过了湖南省技术监督局的计量认证；2007年，我院化学实验教学中心被批准为2007年度国家级实验教学示范中心建设单位，成为全国高校化学化工类26个国家级实验教学示范中心之一，实现了我校创建国家级实验教学平台零的突破。拥有湖南老爹农业科技股份有限公司、湖南省林产化学工程重点实验室2个校内实践教学基地和湖南时代阳光集团、湖南喜阳食品工业集团、株州化工总厂等9个校外实践教学基地。
学院积极整合并利用各种教学资源，重视对外交流和合作。先后与中山大学、湖南大学、湖南师大、湖南农大、湖南时代阳光集团、湖南科力远集团公司、金健米业集团、湘西荣昌集团等多家单位建立了长期的友好合作关系，每年均派出教师外出学习，并接纳国内外的学者前来访问讲学和交流。学院积极参加国际国内多种学术活动，多次主办、协办国内的学术会议，聘请了黄可龙、尹笃林、马美湖、宋建新以及朱光葵、陈振兵、贾霆等一批著名专家学者为学院的特聘和客座教授，与省内外专家进行科研课题研究和科技开发，效果显著。
学院始终树立 “人才立院、质量建院、管理兴院、科技强院”的工作理念，坚持以培养人才为中心，以加快发展为主题，以深化教育教学改革为动力，以提高教育教学质量为目标，不断提高教育教学的质量和水平，近几年共主持国家、省、校级教研教改课题12项，荣获1项省级教学和1项校级教学成果奖，无机化学和有机化学课程被评为校优秀课程，无机化学课程确定为校级“精品”课程。
学院坚持基础研究与应用开发并重，结合自身的专业特点和学科优势，依托四省（市）边区丰富的矿产资源、植物资源和农产品资源，走以学、研、产相结合并相互促进的发展之路。一方面着力加强相关领域的基础研究，另一方面大力开展应用研究和科技开发，其研究成果显著。学院目前承担各类科研项目49项，其中省自科基金项目4项，省科技厅项目5项，省教育厅项目20余项，横向联合项目3项，科研经费达150余万元。近3年发表论文200余篇，其中被国际四大索引SCI、EI等收录的有50余篇，出版专著3部，申请专利9项，位居全校之首，应用研究领域的绿色产品开发、矿产资源开发等已取得良好的社会效益和经济效益，为地方社会经济发展作出了突出贡献。
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