微生物学为江西省重点学科。本学位授权点设有微生物次级代谢产物、微生物遗传育种、微生物发酵工程、大型真菌资源开发利用、生物物质分离及分析五个研究方向。目前由10名硕士生导师（其中教授7人，副教授3人）和一批具有博士和硕士学位的青年教学科研骨干组成。依托该专业建有南昌市发酵应用技术重点实验室、生物技术研究开发中心、应用微生物研究室所、理化分析测试中心、中试发酵基地。实验室和研究室使用面积达5000多米2，具有HPLC仪、PCR仪、凝胶成像系统、冻干机、高速冷冻离心机、气相色谱、8套全自控发酵罐等大型仪器设备135余台（件）。近年承担国家级、省部级项目30余项，省部级以上科技奖5项，获得及申请发明专利5项，国内外发表学术论文150余篇。现有在读研究生70名。研究生毕业后授予理学硕士学位，可在高等院校、科研院所、企事业单位从事教学、科研及管理工作。