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黑龙江中医药大学始建于1954年，初名黑龙江省中医进修学校，后几易其名，1959年定名为黑龙江中医学院，1996年经国家教育部批准更名为黑龙江中医药大学。经半个多世纪的建设与发展，学校已成为具有较高教学、科研、医疗水平，在国内外有一定影响的高等中医药院校，现为黑龙江省重点建设的高水平大学。学校于2004年全国首批获得教育部本科教学工作水平评估优秀结论，2007年全国首家通过教育部本科中医学专业认证单位，2008年被确定为国家中医临床研究基地建设单位，2009年晋升全国精神文明建设工作先进单位。
学校地处风光秀丽的北国名城哈尔滨市，校园环境优雅，绿树成荫， 建筑中西合璧，风格独特，教学主楼和礼堂为典雅的欧式建筑，属国家二类保护建筑；校园内21尊古代著名中医药学家雕像以及“经方小道”等，形成了独具特色的中医药文化园——“大医之路”。
学校下设9个学院、7个附属医院（5个非直属）、1个研究院、16个教学医院和69个实习医院、实习基地。有17个学科具有博士学位授予权，28个学科具有硕士学位授予权。设有18个本科专业及13个专业方向，涵盖医、理、文、工、管、法等多个学科门类。现有全日制在校生13758人，其中博士研究生217人，硕士研究生1118人，七年制学生1155人，本科生7729人，专科生3554人，留学生392人。
学校设有中医学、中药学、中西医结合3个博士后科研流动站，是国家首批第二类特色专业（中医学）建设点和国家第一类特色专业 (中药学、 药物制剂和针灸推拿学)建设点，是国家首批中药类人才培养模式创新实验区。有国家级重点学科4个（其中国家重点培育学科１个）、国家中医药管理局重点学科4个、省级重点学科18个；有国家级精品课程7门，省级精品课程18门，校级精品课程52门。学校为国务院学位委员会批准的临床医学博士、硕士专业学位教育试点院校，国家药品临床研究基地，“长江学者奖励计划”设置特聘教授岗位的高等院校之一。学校教学实验中心首批确定为国家级实验教学示范中心。“十五”以来，获国家教学成果一等奖1项、二等奖4项、省级教学成果奖19项。学校获全国首届优秀高等教育研究机构。
学校现有省部共建教育部重点实验室1个， 国家中医药管理局重点研究室3 个，国家中医药管理局三级实验室4个，省重点实验室3个，省普通高等学校重点实验室4个，黑龙江工程技术中心1个，黑龙江中医药国际科技合作基地1个。“十五”以来，获得各级各类科研课题立项1164项，其中国家“973”项目3项、“863”项目1项；获得各级各类奖励358项，其中国家科技进步二等奖6项、中华中医药科技进步一等奖1项、黑龙江省科技进步一等奖4项。在中药血清药物化学研究、 中药天然药物药效物质基础研究方面处于国际先进水平，在方剂配伍规 律、针灸作用机理研究和中医药治疗内科、 妇科、 肾病等重大疾病的临床研究方面处于国内领先水平。2008年，学校培养的博士撰写的论文获得教育部、国务院学位委员会“全国优秀博士学位论文”，成为全国第三个获此殊荣的中医药大学。
学校附属第一医院（临床医学院）为国家中医临床研究基地建设单位、国家三级甲等医院、全国示范中医医院。学校附属第二医院（针灸推拿学院）是以针灸推拿康复为特色的三级甲等医院，为全国首批现代化中医院建设单位。两附院有国家级医疗中心和重点专科5个、省级医疗中心和重点专科6个。
学校现有教职工2449人（校本部1093人）。其中教授、副教授及相应职称人员685名，博士研究生导师86人，硕士研究生导师221人，有38位专家享受政府特殊津贴，卫生部有突出贡献中青年专家3名，百千万人才工程国家级人选4人，国家级教学名师2名，全国先进工作者1名，巾帼建功标兵1名，全国优秀教师6名。现有长江学者讲座教授1人，龙江学者特聘教授5人。中药化学教学团队、方剂学教学团队、中医内科学教学团队被评为省级教学团队，中药化学教学团队被确定为国家级教学团队。
学校创办了省内唯一一家药物安全性评价中心，建立了黑龙江省中药材GAP研究中心；组建的“省医药工业校企合作专业委员会”，与多家企业合作，分别成立了黑龙江中医药大学久久药业和“黑龙江明嘉北药萃取技术开发有限公司”等校企联合的科技实业；建成了占地100万平方米的黑龙江中医药大学清河中药材种子种苗繁育基地，并在黑龙江省14个市、县建成中药材GAP示范基地。
学校具有接收外国留学生和港澳台学生学历教育资格，是教育部首批批准招收来华留学生院校之一，已同世界上30多个国家和地区的近40所医学院校或研究机构开展了教育、医疗、科技合作与交流，目前学校长期国际合作项目41项，培养外国留学生及港澳台学生4967人,接受国外来访学者500多人。多次承办大型国际学术会议，举办了五届“中俄药学论坛”。与英国伦敦南岸大学、哈尔滨师范大学联合在英国创办了世界首家中医孔子学院，已正式在欧洲招生。
学校教学科研设备总值近亿元，有电子显微镜（透射）、激光共聚焦扫描仪等一批大型精密仪器设备。学校图书馆藏书91万册，实现文献采集、借阅及检索自动化、网络化。中医药文献检索中心被确定为中国中医药文献检索分中心，实现了文献检索国际化。学校编辑出版的《中医药学报》、《中医药信息》、《针灸临床杂志》均为中国自然科学Ⅰ类期刊，均被收录为中国科技核心期刊。
学校不断强化学生创新能力和实践能力的培养。大学生社会实践活动连续十几年受到中宣部、 教育部、团中央联合表彰。建校以来，为国家培养近三万名 中医药人才，大批毕业生已经成为国内外各级各类医疗机构、科研院所、医药院校、政府机构和著名企事业单位的中坚骨干。
学校正在党的十七大精神指引下，以科学发展观统领学校全局，继续解放思想，深化改革，科学发展、和谐发展、率先发展，为建设国内一流、国际上有一定影响的高水平中医药大学而努力奋斗！
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