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法医学是一门应用性交叉性医学学科，学科下设法医病理学、法医物证学、法医临床学、法医毒理学、法医毒物分析和法医精神病学等重要分支学科。法医学学科为各类刑事、民事、行政案件的侦查、起诉和审理提供重要线索和核心证据，为保障人权、保障司法公正和社会稳定提供强有力的技术支撑，是国家法制建设的重要组成部分。
我校法医学科创建于1984年，是全国最早招收法医学本科生的8所医科院校之一，1988年10月成立法医学系，2002年8月成立法医学院，现下设法医学和医事法学两个本科专业。法医学为云南省重点专业，云南省法医学研究生教育创新基地和校级重点建设学科。1996年10月获法医学学科硕士学位授权点，硕士导师8名，招生10届56名硕士研究生。从国内总体发展情况看，6所部属院校法医学教学科研处于国内第一层次水平，我校法医学科处于国内第二层次前列水平。
我校法医学学科经过24年的建设和发展，形成了“联合办学，一专多能，综合发展”的鲜明办学特色，形成了稳固的、较高水平的学科特色研究领域和优势学科方向。在毒品滥用毒理病理和成瘾机制研究、颅脑损伤与认知行为障碍、少数民族遗传多态性研究方面形成明显优势，研究成果处于国内领先水平。拥有云南省中青年学术和技术带头人1名，校级学科带头人3名，骨干教师5名，形成了富有实力的学科研究骨干团队，22人次担任国家、省级学术团体职务。主持承担国家自然基金项目5项，省部级项目12项，主编、参编20部学术专著和规划教材，获省部级科技进步奖10项，省级教学成果奖3项，公开发表学术论文500多篇，其中核心期刊100多篇，SCI收录论文7篇。
拥有法医学主干学科实验室6个，设备总价值近400万元，共享省内6个公安教学基地的设备、实验室资源和云南省公安厅省级重点实验室刑事技术实验室。118名公安法医学和刑侦专家为我校兼职教师，共同承担法医学人才培养工作。呈贡新校区法医学院拥有7200M2的法医实验大楼，为法医学科的进一步发展提供了良好的空间。昆明医学院司法鉴定中心，作为法医学人才培养的重要教学基地，在省内享有较高的声誉，在省内法医学鉴定领域处于领先地位。
法医学科具备良好的基础条件和学科特色优势，学科研究方向与云南经济社会发展和法制建设密切相关，具有巨大的发展空间和潜力。“十一五”期间，法医学学科建设发展的主要目标是成为省级重点建设学科和法医学博士授权学科。
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